在，交通违法行为的处罚通常遵循《国道路交通安全法》及其实施条例的规定。超速12分（即超过法定速度限制12%）是严重的违法行为，根据该法律，驾驶人将面临罚款、扣分以及可能的暂扣或吊销驾驶证等处罚。
关于是否可以将超速12分的违法行为分为两次进行处罚的问题，这取决于具体的法律规定和执法的决定。通常情况下，如果驾驶人在一个记分周期内累计积分达到12分，那么在下一个记分周期开始时，其累积的分数将被清零，并且需要重新计算新的积分。这意味着，如果驾驶人在第一次被处罚后没有立即纠正违法行为，第二次超速行为可能会被视为新的违法行为，并按照新的记分周期进行处理。
具体情况可能会有所不同，因为不同的地区和执法可能有不同的规定。在某些情况下，执法可能会考虑到驾驶人的改正态度和行为表现，决定给予一定的宽容处理，允许驾驶人在一定时间内补交罚款或者通过其他方式来抵消部分或全部的违规积分。
如果你面临这种情况，建议你咨询当地的交通管理部门或律师，了解具体的法律条款和执法实践。为了避免再次发生类似违法行为，建议遵守交通规则，保持安全驾驶，不要超速行驶。