正如小说和电影所描述的那样，霍格沃茨之遗包含了四个特色各异的学院。对于不熟悉哈利波特系列情节的玩家们来说，这四个学院的差异可能让人摸不清头脑，接下来就为大家逐一介绍。
格兰芬多学院（狮院）——崇尚勇敢、活力四溢、骑士精神至上，其标志性的颜色是红金色。
拉文克劳学院（鹰院）——思维敏锐、机智过人、学识渊博，以蓝棕色为象征色彩。
斯莱特林学院（蛇院）——目的至上，手段多样，绿银色为其代表颜色。
赫奇帕奇学院（獾院）——崇尚正直、忠诚坚定、诚实守信、不畏艰辛，黄灰色是其学院色彩。
在分院仪式中，学员们可以根据自己的性格和喜好来选择学院，一旦做出选择，身上的长袍会立刻变幻为所选学院的色彩。
选择学院后的不同体验
公共休息室的位置各异：狮院和鹰院的公共休息室都设在各自的创始人塔楼之内。獾院休息室与霍格沃茨的厨房相邻，而蛇院的休息室则位于神秘的水底地牢。值得注意的是，玩家们只能进入自己学院的公共休息室。
学院：各学院的主要区别在于颜色和胸前的徽章。
同窗好友：随着游戏的进展，每个学院的学员都有独特的对话情节，但这些对话并不会影响游戏的主线剧情。
独特的支线任务：或许最明显的区别就在于各个学院的支线任务了。例如，狮院的玩家们将协助无头尼克及其他幽灵，而獾院的玩家则将体验一次阿兹卡班的冒险之旅。